全自動(dòng)菌落計(jì)數(shù)器是由圖像輸入、圖像處理軟件與數(shù)據(jù)儲(chǔ)存三個(gè)部分組成。軟件系統(tǒng)通過圖像輸入設(shè)備對培養(yǎng)好的菌落進(jìn)行數(shù)字化圖像采集。
經(jīng)usb口數(shù)據(jù)通信傳輸?shù)接?jì)算機(jī)終端計(jì)數(shù)憑條，對輸入的數(shù)字圖像進(jìn)行一系列圖像算法處理，輸出計(jì)數(shù)結(jié)果，根據(jù)情況進(jìn)行人工校正，計(jì)數(shù)完成后可對相關(guān)文件進(jìn)行保存，將輸出的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在計(jì)算機(jī)中。
目前，大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室仍然采用傳統(tǒng)的人工肉眼結(jié)合菌落計(jì)數(shù)器的計(jì)數(shù)方法：借助放大鏡的觀察，用計(jì)數(shù)筆點(diǎn)擊每一個(gè)菌落，計(jì)數(shù)器計(jì)數(shù)每一個(gè)點(diǎn)擊產(chǎn)生的壓力電子脈沖得出總數(shù)。這樣雖然成本低廉，但是也有很多的缺點(diǎn)：
1、識(shí)別和計(jì)數(shù)錯(cuò)漏
所有的計(jì)數(shù)都依靠壓力對壓力脈沖產(chǎn)生次數(shù)的記錄，不同人員的操作產(chǎn)生的壓力不同就難免產(chǎn)生漏記，而且計(jì)數(shù)的結(jié)果也因操作人員對菌落的識(shí)別經(jīng)驗(yàn)不同而產(chǎn)生差異，系統(tǒng)偏差較大。很多實(shí)驗(yàn)室在采用一段時(shí)間的全自動(dòng)菌落計(jì)數(shù)器輔助計(jì)數(shù)以后，又“回歸”純粹人工肉眼計(jì)數(shù)。
2、標(biāo)記和修正不便
肉眼計(jì)數(shù)和菌落計(jì)數(shù)器計(jì)數(shù)都依靠計(jì)數(shù)筆在被統(tǒng)計(jì)的菌落上留下墨水筆跡來進(jìn)行標(biāo)記，因此在存在密集菌落的情況下就標(biāo)記不便，而且發(fā)現(xiàn)誤統(tǒng)計(jì)時(shí)需擦去墨水痕跡導(dǎo)致修正不便。
3、效率低下
肉眼計(jì)數(shù)和全自動(dòng)菌落計(jì)數(shù)器計(jì)數(shù)都需要人工用肉眼識(shí)別每一個(gè)菌落，因此一旦樣品較多就會(huì)耗費(fèi)大量的時(shí)間，影響研究或是結(jié)果報(bào)告的效率。
4、原始結(jié)果無法保存
在做完統(tǒng)計(jì)后，留下了一個(gè)統(tǒng)計(jì)數(shù)字，而對記錄和驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)結(jié)果很重要的培養(yǎng)平板表面菌落生長狀況卻因?yàn)槠桨宓南吹舳鵁o法保存。